Cytochróm C je primárne známy ako mitochondriálny proteín nesúci elektróny. Prechod cytochrómu c medzi železnatým a železitým stavom v bunke z nej robí účinný biologický transportér elektrónov a hrá dôležitú úlohu pri bunkovej oxidácii v rastlinách aj živočíchoch.. Vo všeobecnosti sa považuje za univerzálny katalyzátor dýchania, vytvára zásadný elektrónový most medzi dýchateľnými substrátmi a kyslíkom.
Zložka elektrónového transportného reťazca v mitochondriách, cytochróm c sa považuje za funkčný komplex využívaný v nízkoúrovňovej laserovej terapii (LLLT), čo zvyšuje metabolickú aktivitu a uvoľňuje viac energie pre bunky na opravu tkaniva. Vykazuje aktivitu peroxidázy oxidáciou rôznych donorov elektrónov, ako je 2,2-azino-bis(3-kyselina etylbenztiazolín-6-sulfónová) (ABTS), 2-kyselina keto-4-tiometylmaslová a 4-aminoantipyrín. Používa sa ako dôležitý mediátor v apoptotických dráhach.
Cytochróm c je známy predovšetkým svojou funkciou v mitochondriách ako kľúčový účastník životne dôležitých funkcií syntézy ATP.. Avšak, keď bunka dostane apoptotický stimul, cytochróm c sa uvoľňuje do cytosólu a spúšťa programovanú bunkovú smrť prostredníctvom apoptózy.
Má rýchly enzymatický účinok na oxidačný a redukčný proces buniek v tkanivách. Používa sa pri hypoxii tkaniva spôsobenej z rôznych príčin pri prvej pomoci alebo pomocnej liečbe. Leukopénia spôsobená protirakovinovými liekmi, poruchy krvného obehu končatín, ochorenia pečene a zápal obličiek majú tiež určité terapeutické účinky.